下一代DNA序列的最新進展導致在人參潘內克斯(Ginseng Panex)發現了新的基因型,從而改變了我們證明和理解這種重要的藥用植物的方式。研究人員Christopher Oberc博士和Simon Fraser的Paul Li博士使用複雜的技術來檢測這些基因型,這標誌著植物遺傳學領域的重要一步。他們的發現發表在Heliyon上,詳細介紹了這項最初工作的方法和含義。

Panax Ginseng和Panax Quinquefolius,通常稱為中國/韓國銀河和美國/加拿大人參,是Paneax性別中的兩個主要物種。儘管存在形態學差異,但這些物種之間的差異在將其處理成諸如切片或灰塵之類的商業產品中時變得具有挑戰性。因此,超越了這些限制的遺傳身份驗證已成為必不可少的工具。

在他們的研究中,Oberc博士和Li博士使用下一代(NGS)序列以各種形式分析了14個人參樣本。這種方法使他們可以從每個樣品中接收數百萬個DNA讀數。使用洞穴輪對準器(BWA)和基於Python的收集分析,他們確定了樣品之間的新基因型。可以肯定地確認了兩個樣品,而其他樣品則表現出雜種特徵,揭示了這些植物的複雜遺傳性質。

Dr.博士說:“下一代序列提供了一個強大的平台,可檢測超出簡單點突變的遺傳變異。”該團隊應用了一種稱為高斯混合收集的機械學習算法來分析序列數據,這使他們能夠將人參樣本分類為不同的基因型。該研究揭示了一種無反應的基因型,為我們對Paneax物種的遺傳多樣性的感覺增加了新的層。

主要發現之一是CCG基因型的鑑定,該基因型以前尚未記錄。這種遺傳學的含義超出了學術利益。人參的遺傳認證可以顯著影響商業工業,從而確保人參產品的純度和真實性。考慮到人參的高市場價值和藥物重要性,這一點尤其重要。有了這些新的基因型信息,製造商可以更好地驗證其產品的真實性,從而使客戶對購買的人參質量有更高的信心。

此外,該研究強調了使用遺傳信息改善人參培養和商業化的潛力。了解Pataax物種內的遺傳多樣性,研究人員和農民可以製定更好的繁殖和增強人參策略,從而優化其藥用特性和市場價值。

在這項研究中,成功實施NGS和機械學習的分析也為未來的植物遺傳學研究樹立了先例。由Oberc博士和Li博士開發的方法可以適應並應用於其他植物物種,從而提高了我們產生和遺傳研究不同藥用植物的能力。這一進展為草藥領域的研發開闢了新的方法,在那裡,基因認證對於確保草藥產品的安全性和效率至關重要。

https://www.youtube.com/watch?v=ub-_cmlccvi

總之,克里斯托弗·奧伯克(Christopher Oberc)和保羅·李(Paul Li)博士的工作代表了Panax Ginseng的遺傳證書的重大進展。他們使用下一代序列發現新基因型的發現不僅加深了我們對人參遺傳多樣性的理解,而且還提供了實用的工具來確保人參產品的真實性和質量。這項研究說明了現代遺傳技術在推進藥用植物領域的科學知識和實際應用方面的力量。

日記

Oberc,C。和Li,PCH(2024)。 “下一代PANAX樣品的DNA序列發現了新的基因型:Aligner-Rrota Burrows,豐度和基於Python的收集分析。” Heliyon,10,E29104。 doi: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e29104

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